질량 ++를 사용한 LC-Maldi-TOF/TOF 데이터 분석

2014-3-4 Tsumoto Hiroki, 바카라 사이트 쿠폰원, 바카라 사이트 쿠폰원, 바카라 사이트 쿠폰팀, 노화 기관, 도쿄 건강 및 장수 의료 센터

(http : //www.tmghig.jp/j_tmig/kenkyu/team/proteome.html)

우리의 바카라 사이트 쿠폰팀은 NANOLC-MALDI-TOF/TOF 시스템을 사용하여 프로테옴 분석을 수행합니다. 이번에는 Mass ++를 사용하여 데이터를로드 할 수 있었으며 HeatMap 디스플레이 기능을 사용하여 데이터를 살펴보면 데이터베이스 검색을 통해 보이지 않는 번역 후 수정이 있음을 발견했습니다.

단백질의 트립신 소화를 분석 할 때, 동일한 펩티드는 상이한 체류 시간에서 동일한 m/z 값을 갖는 신호 A 및 B로부터 확인되었다 (도 1). 그러나, 왜 동일한 펩티드가 상이한 체류 시간으로 확인되었는지는 확실하지 않았다.

그림 1. 추출 된 이온 크로마토 그램

따라서 데이터를 MZML 형식으로 변환하여 Mass ++로로드 한 다음 히트 맵을 표시했습니다 (그림 2). 적색 화살표에 의해 나타낸 바와 같이, 신호 A 및 B에 대해 고 분자량 측면으로 이동하는 신호가 발견되었으며, 신호 C 및 D는 빠른 유지 시간에 검출 된 신호 A를 위해 고 분자량 측면에 존재한다는 것이 밝혀졌다. 이들 빨간색 화살표에 의해 나타난 m/z 값의 MS/MS 스펙트럼은 모두 동일한 패턴을 가졌기 때문에, 동일한 서열의 펩티드에 대한 번역 후 변형이며, 신호 C 및 D는 분자량 차이에 기초한 산성 번역 후 변형으로 간주된다. 이 분석의 결과는 새로운 번역 후 수정 가능성을 보여 주며 바카라 사이트 쿠폰 개발을 희망합니다.

그림 2. 질량 ++를 사용한 LC-MALDI 데이터의 히트 맵 표시

Mass ++의 Heatmap 디스플레이 기능은 읽기 쉽고 신호를 구별하는 데 유용했습니다. 우리는 LC-MALDI 데이터의 분석 소프트웨어로서 향후 추가 개발이 진행되기를 바랍니다.