발표의 포인트

• 우리는 새로운 약물의 납 화합물로 예상 될 수있는 지방산 및 펩티드 화합물로 혼성화 된 독특한 천연 바카라 백본 인 PK/RIPP 하이브리드 리포 펩티드의 새로운 그룹을 발견했습니다.
• 화학 바카라는 가스 상 라디칼 조사를 사용하여 새로운 질량 분석법 (HIRID ™ -MS/MS)을 개발하고 적용함으로써 먼저 명확 해졌으며, 이는 매우 긴 반복 바카라로 복잡한 탄소 사슬 화학 바카라를 효율적으로 분석합니다.자세한 내용을 보려면 여기를 클릭하십시오(Tanaka Koichi Memorial Mass Spectrometry Research Institute Page of 바카라 Seisakusho에 링크)
• 새로운 분석 방법의 확립과 새로운 천연 제품 그룹의 발견은 천연 제품의 바카라적 다양성을 확장 할 것이며, 천연 제품은 제약으로 더욱 유용 할 것으로 예상됩니다.

바카라 요약

오나카 히로야스 교수, 도쿄 대학교 생명 과학 대학원, 아베이 쿠로 교수, 제약 과학 대학원, 타나카 코이치 (Tanaka Koichi), Shimadzu Seakusho, Shimadzu Seakoppeptide (Pk/Rippepptide)를 발견했습니다. 이는 지방산 및 펩티드 화합물로 하이브리드 화되며, 이는 신약의 원료로 예상 될 수있다 (도 1). 기존의 분석 방법을 사용하여 PK/RIPP 하이브리드 리포 펩티드 화합물의 화학 바카라를 결정하는 것은 어려웠지만, 시마 즈 (Shimadzu)의 타나카 코이치 (Tanaka Koichi Memorior) 질량 측정 실험실 (Tanaka Koichi Memorial Mass Spectrometry Laboratory)에 의해 새로 개발 된 HIRID-MS/MS 장치 (주 2)에 의해 결정되었다.
이번에 발견 된 화합물은 Goadvionin이라는 PK/RIPP 하이브리드 리포 펩티드이며 그람 양성 박테리아의 성장을 억제합니다 (그림 3). 복잡한 화학 바카라는 32 개의 탄소와 8 개의 아미노산으로 구성된 펩티드 화합물 (주 4)으로 구성된 매우 긴 사슬 길이 지방산 (주 3)의 하이브리드 하이브리드로, 기존 분석 방법을 사용하여 화학 바카라를 결정하기가 어렵다. Godobionin의 생합성에 필요한 유전자를 분석하고 생합성 과정을 설명 한 후, Godobionin과 유사한 바카라를 갖는 Pk/Ripp 하이브리드 화합물이 미생물에 널리 분포된다는 것이 밝혀졌다 (도 4).
현재 결과는 새로운 화학 바카라 분석 기술을 통해 새로운 유용한 천연 제품 그룹이 발견되었으며, 복합 분석 기술 개발과 자연 제품 검색 연구 간의 협력은 제약에서 천연 제품으로의 적용을 확대 할 것입니다.

발표

미생물 및 기타 유기체에 의해 생산되는 천연 제품은 제약에서도 사용되는 중요한 화학 물질입니다. 오랜 역사에서 인류는 전염병과 결핵을 포함한 다양한 전염병으로 고통 받고 있습니다. 대조적으로, 페니실린의 발견 이후, 청색 곰팡이에 의해 생성 된 항생제 인 인간은 감염성 질환을 조절하기 위해 결핵에 대한은 총알을 포함한 다양한 천연 생성물 유래 항생제를 개발했습니다. 그러나 코로나 바이러스를 포함한 새로운 전염병이 서로 발생하고 있기 때문에이를 다루기 위해 약물을 개발해야합니다. 약물 개발의 중요한 요점 중 하나는 새로운 약물이 될 수있는 다양한 후보 화합물을 갖는 것입니다. 그러나 천연 제품에 의존하여 후보 화합물의 유형에는 한계가 있습니다 (주 5). 반면, 복잡한 바카라를 가진 많은 화합물은 화학 합성 방법을 사용하여 합성되지만 바카라가 복잡할수록 비용이 많이 들고 시간이 많이 걸리며 천연 제품과 같은 복잡한 화학 바카라를 쉽게 만들기가 어렵습니다. 새로운 천연 제품을 발견하는 것은 약물 개발에서 중요한 연구 주제 중 하나입니다.
이번에는, 이번에는, 오나카 히로야수 교수, 도쿄 생명 과학 대학원, 도쿄 대학교, 아베 이쿠로 교수, 제약 과학 대학원, 타나카 코이치 (Tanaka Koichi), 타나카 코이치 (Tanaka Koichi), 타나카 코이치 (Tanaka Koichi), Shimator Massetrometry Institution, Shimator Masse Masse Ground at a New Masse Ground a Seakusho, Tanaka Koichi, Tanaka Koichi, Tanaka Koichi. PK/RIPP 하이브리드 리포 바카라라고하는 생성물은 다양한 미생물 종에 존재합니다.
지방산 및 펩티드의 하이브리드 (융합)의 화학 바카라는 두 화합물의 다양한 조합을 허용하여 천연 제품의 화학 바카라 및 생리적 활성의 다양성을 넓히게합니다. 현재까지, 지방산과 펩티드를 결합한 일부 화합물 (리포 펩티드)은 의약품으로 방출되었다. 연구 그룹은 미생물 내의 합성 과정이 전통적인 리포 펩티드의 합성 과정과 다르며, 화합물 그룹, PK/RIPP 하이브리드 리포 펩티드는 리포 펩티드와 크게 다른 화합물 그룹으로 자연적으로 발생한다는 것을 보여 주었다.
이번에는 Goadvionin이라는 그람 양성 박테리아의 성장을 억제하는 PK/RIPP 하이브리드 리포 펩티드는 Actinomyces Streptomyces sp. TP-A0584 (주 6). Godobionin은 매우 긴 아실 사슬 (Trimethylamino 32 Carbon Acyl Chain, Note 7) 및 복잡한 변형 된 펩티드 바카라 (Abionine-containing Lantheptide, Note 8)로 구성됩니다 (그림 1). 매우 긴 아실 사슬에서 6 개의 하이드 록시 그룹의 위치와 1 개의 이중 결합은 기존의 분석 기술을 사용하여 바카라적으로 분석하기가 어려웠으므로, 이들은 hirid-MS/MS 기기에 의해 결정되었으며, 이들은 Shimadzu의 타나카 코이 치 (Tanaka Koichi) 기념 질량 측정 실험실에 의해 새로 개발 된 Hirid-MS/MS 기기에 의해 결정되었다. 2).
우리가 Godobionin의 생합성 유전자를 바카라하고 생합성 과정을 드러 냈을 때, 아실 사슬 및 펩티드 체인 및 하이브리드 화가 아실 트랜스퍼 라제 (주 9) 및 GDVG에 의해 촉매되는 반응은 Gnat Superfamily에 속한 것으로 밝혀졌다. 전통적인 아실 트랜스퍼 라제와는 달리,이 반응은 아실 캐리어 단백질 (ACP)에 연결된 매우 긴 아실 사슬을 펩티드 모이어 티의 N- 말단 아미노기에 전달하는 것으로 밝혀졌다 (도 3). 이 독특한바카라우리가 유전자를 지표로 바카라 이전에보고 된 미생물 게놈을 검색했을 때, 우리는 다양한 미생물, 주로 actinomycetes바카라그것은 상동 유전자가 있음이 밝혀졌습니다 (바카라 4).
이 연구는 (1) 광범위한 미생물 종이 PK/RIPP 하이브리드 리포 펩티드를 생성하고 (2) 아실 사슬의 GDVG- 유사 아실 트랜스퍼 라제-유사 아실 트랜스퍼 라제-유사 아실 트랜스퍼 라제-유사 아크릴 레이트 하이브리드 화는 PK/Ripppeptides의 생합성 전략에서 공통적 인 전략이라는 것을 보여준다. 또한, 현재 결과에서와 같이, 새로운 화학 바카라 분석 기술을 천연 제품 검색 연구와 결합함으로써, 이전에 발견 된 새로운 천연 제품은 향후 효율적으로 발견 될 것으로 예상된다.
이 바카라자연 바카라에 게시 Goadvionin 하이브리드 리포 바카라의 폴리 케 타이드 및 바카라 모이어 티의 축합을 촉진하는 제목 아실 트랜스퍼 라제 하에서.
이 연구를 실시한 도쿄 대학교 농업 대학원의 미바카라 잠재 효소의 과정은 Amano Enzyme Co., Ltd.에서 기부 한 기부 과정입니다.
Tanaka Koichi Memorial Mass Spectrometry Research Institute는 2003 년 1 월 Tanaka Koichi 박사 (현재 이사)가 2002 년에 바카라에서 노벨상을 수상한 Dr.

바카라 된 잡지

잡지 이름	：	"자연 바카라"(온라인 버전 7 월 27 일)
바카라 제목	：	Goadvionin 하이브리드 리포 바카라의 폴리 케 타이드 및 Peppere Moieties의 응축을 촉진하는 아실 트랜스퍼 라제
저자	：	Ryosuke Kozakai, Takuto Ono, Shotaro Hoshino, Hidenori Takahashi, Yohei Katsuyama, Yoshinori Sugai, Taro Ozaki, Kazuya Teramoto, Kanae Teramoto, Koichi 바카라, Ikuro Abeiiiiiiizi 그리고 hiroyasu onaka
doi 바카라	：	10.1038/바카라020-0508-2
Abstract url	：	https://www.nature.바카라m/articles/s41557-020-0508-2

바카라집

(주 1) PK/RIPP 하이브리드 리포 펩티드 : PK는 폴리 케 타이드 화합물을 나타내며 변형 된 폴리 케톤 사슬이있는 바카라로 천연 제품의 주요 탄소 골격 바카라 중 하나입니다. RIPP는 리보솜 번역 기반 번역 후 변형 된 펩티드의 약자이며, 펩티드 화합물 (주 4)이 번역 후 변형을 갖는 바카라를 가지고있어 천연 제품의 주요 탄소 골격 바카라 중 하나입니다. PK/RIPP 하이브리드 리포 펩티드는 PK 및 RIPP의 하이브리드 (응축) 바카라를 갖는다.

(주 2) 기상 라디칼 조사 (HIRID-MS/MS, 고도로 통합 된 라디칼 유도 된 해리 MS/MS)를 사용한 질량 바카라 : C-C 결합을 사용하여 단편을 사용하여 단편을 사용하여 단편을 사용하여 측정 된 샘플 이온 (MUS) (MOL Special at MOL)에 의해 C-C 결합의 단편화를 허용하는 질량 바카라 방법. *특허 번호 0629790 및 기타 3 개 항목

(주 3) 지방산 : 지방산은 탄소 사슬 (아실 사슬)을 갖는 카르 복실 산 (R-COOH)의 일반적인 용어입니다. 예를 들어, 식물성 오일에 함유 된 올레산 및 리놀레산은 탄소 사슬 길이가 18 인 지방산이다.이 연구에서 바카라 된 Godobionin은 탄소 사슬 길이가 31 (32 개의 탄소 원자) 인 매우 긴 지방산을 함유한다.

(주 4) 바카라 화합물 : 다수의 아미노산은 바카라 결합 (-Co-NH₂-)와 연결된 화합물에 대한 일반적인 용어. Godobionin에는 8 개의 아미노산이 연결된 펩티드 바카라가 있습니다. 단백질은 또한 넓은 의미에서 펩티드 화합물이지만, 수백에서 수천 개의 연결된 많은 아미노산이 연결되어있다.

(주 5) 천연 제품에 의존하는 식품 유형에는 한계가 있습니다. 지금까지 인간은 미생물 및 식물과 같은 제약의 원료로 사용되는 천연 제품을 찾고 있습니다. 결과적으로, 새로운 바카라를 가진 천연 제품의 수는 최근 몇 년 동안 감소하고 있으며, 주요 천연 제품은 이미 소진되었다고합니다. 현재 드문 천연 제품을 발견하기 위해, 우리는 또한 게놈 정보를 사용하여 특수 환경에 사는 희귀 미생물을 검색하는 효율적인 검색 방법을 사용하고 있지만, 현재의 상황은 새로운 천연 제품이 항상 효과적으로 발견되지는 않는다는 것입니다.

(참고 6) Actinomycetes : 균사체를 키우고 다양한 종을 가진 진정한 박테리아 바카라. 그것은 토양에 널리 살고 있으며 환경에서는 유기물의 분해 자 역할을합니다. 산업적으로, 그것은 항생제를 포함한 다양한 2 차 대사 산물을 생성하고 결핵 치료 스트렙토 마이신, 항생제 적혈구 타크로이머스, 면역 억제제 타크 롤리 무스 및 항 피성 약물 약물을 생성하는 박테리아로 알려져 있습니다.

(주 7) 매우 긴 아실 사슬 (Trimethylamino 32 Carbon Acyl Chain) : 아실 사슬은 탄수화물이 연속적으로 연결되고 분자의 한쪽 끝이 Co 인 바카라를 보여줍니다. Godobionine의 경우, R의 바카라는 매우 길며, 분지 된 메틸기를 포함하여 32 개의 탄소 원자로 구성된 31 개의 탄수화물의 연속적인 연계가 있으며, 말단 말단은 트리메틸 아민 (CH₃)₃n-로 바카라됩니다.

(주 8) 복잡한 변형 된 펩티드 바카라 (Abionin-containing lantenipeptide) : Godobionin의 펩티드 부분은 리보솜에 의해 번역되고 합성 된 다음, 2 개의 효소 GDVKC 및 GDVD에 의해 항공 바카라로 변형 된 후 변형된다.

(주 9) GNAT 슈퍼 패밀리에 속하는 아실 트랜스퍼 라제 : 아실 트랜스퍼 라제는 아실기를 전달하는 촉매 반응을 갖는 효소이다. 그것은 일반적바카라 CoA에 결합 된 아실기 (아실 코아)가 아미노기로 옮겨 진 반응을 촉매한다. 그러나, GDVG 기질은 COA 형태가 아니라 오히려 아실 캐리어 단백질 (ACP)에 결합 된 아실기를 사용한 반응을 전달한다.

첨부

그림 1 Godobionin의 화학적 바카라, PK/RIPP 하이브리드 리포 펩티드의 유형
이것은 이번에 발견 된 8 가지 유형의 Godobionin 그룹 중에서 Godobionin B4의 화학 바카라입니다. PK와 RIPP 부위의 두 바카라는 혼성화되어 있으며 독특하고 매우 긴 선형 지방산이 특징입니다.

그림 2 : 가스 상 라디칼 조사를 사용한 질량 바카라 (HIRID-MS/MS)의 요약

그림 3 바카라의 생합성 동안의 혼성화 메커니즘
Godobionin은 GDVG 아실 트랜스퍼 라제 효소에 의해 PK 부위를 RIPP 부위의 아미노 터미널로 혼성화함바카라써 생물 합성화된다.

바카라 4바카라상동 바카라는일부는 게놈 내의 광범위한 미바카라 종에 존재합니다.
바카라는 상 동성 유전자가 바카라 된 미생물 게놈의 유전자 배열을 보여준다. 상단 유전자 맵은 이번에 바카라 된 Godobionin 생합성 유전자 그룹입니다. 아래는 다양한 미생물 종입니다바카라상동 바카라가 존재한다는 것이 밝혀졌습니다.바카라상 동체 유전자는 빨간색바카라 표시됩니다.

*Hirid 및 LCMS-IT-TOF는 바카라 Seisakusho Co., Ltd.의 상표입니다.